کاروانسرای مظفری مربوط به دوره آل مظفر است و در نزدیکی آرامگاه کوروش قرار دارد. این کاروانسرا دارای حیاتی به مساحت ۲۰۸ مترمربع، یک ایوان و چندین اتاق است.