موزه تاریخ طبیعی همدان در دانشکده کشاورزی دانشگاه بوعلی سینا، در انتهای چهار باغ آزادگان واقع شده است. مجموعه ای کم نظیر از نمونه های انواع گونه های حیوانی، گیاهی و طبیعی اقلیم ایران و اقصی نقاط جهان در این موزه گردآوری شده است. در این مجموعه، هزاران نمونه زنده، سنگواره و تاکسی درمی شده از گونه های گیاهی، پستانداران، پرندگان، خزندگان، حشرات و آبزیان به شیوه های مدرن و علمی نگهداری می‌شود. موزه تاریخ طبیعی همدان در سال ۱۳۵۱ به همت استاد جعفر محمد علیزاده احداث شده است و تمام نمونه ها با همت ایشان و دانشجویان علاقه مند جمع‌آوری شده است.